Alors qu'on le pensait mort, des indices laissent entendre que Michael Scofield pourrait être vivant. Lincoln et Sara se rallient afin de construire le plan d'évasion le plus important de la série et entraînent avec eux les trois évadés les plus connus du pénitencier d'état de Fox River, Sucre, T-Bag et C-Note. 9 épisodes.